哈尔滨工业大学：先进焊接与连接国家重点实验室、机器人技术与系统国家重点实验室（筹）、城市水资源与水环境国家重点实验室、精密热加工国防科技重点实验室、可调谐（气体）激光国防科技重点实验室、特种环境复合材料技术国防科技重点实验室、空间环境材料行为及评价技术国防科技重点实验室、燃煤污染物减排国家工程实验室
哈尔滨工程大学：水声技术国防科技重点实验室、水下机器人技术国防科技重点实验室
东北林业大学：东北森林资源培育实验室、森林病虫害生物学实验室、野生动物保护生物学实验室、木材科学与工程实验室
东北农业大学：国家乳业工程技术研究中心、国家大豆工程技术研究中心
哈尔滨医科大学：国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、中国疾病预防控制中心地方病控制中心、国家新药临床试验研究中心
黑龙江大学：国家糖料改良中心、作物遗传改良国家重点实验室东北开放合作基地
黑龙江中医药大学：北药基础与应用研究国家重点实验室
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